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COG category: Transcription
Organism: Borrelia duttonii Ly, Ly

Number of genes found: 25

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# Borrelia duttonii Ly, Ly

>BDU_523 Response regulator receiver (CheY) modulated Serine phosphatase
TTGAGGATGAATAGTAATAATGTTATTAATGTATTAAATGAATTTGGTTT
AAAAATAGAAGAGATTTTTTTACTTATCAATACTTATTCTTATGCACTCT
ATAAAGAAACTCCTAGATATTTTTATGATGATATTACTAATTACCTTGAA
TTAACTTTAGATATTGCTAATAAATTTCAGGGAGAGTTTGCAGATTCTAA
AGATTTGAAGTTGGGTAAATTTATGCTTAGAAGCATGAAGTGCGATTTAA
TGTCTTATTTATATTTGTCTTTGGAATTAATAGATAATTCTATGCATTAT
AGTGGAATTGGAGATGCTGGTATTGCCTTTTTTAAGGCCATTTCGTGTAA
AATTTTATCGGTAATATCTTATATAGAGATTGAGTTTGAGAATATGGTTT
TCTCTTCTGCTCTTAAGAATAGAAAAGATGCAAATAAGGGTGGTAATCAG
TTATTGATTTTTTCTTGTGAGAGTGCTTATAGTACAAAACTTGTCAATTA
TTTGATTTTAAAAGACTATATTGTTATATCTGCAAATACTGTAGATTTGT
TTAGTCAGTTACTCTGTGATAATTTTTATGATTTGATTATTCTTGATTTA
AATTCGGATGAAAATATTCAGATGATTTTAGATTTACTTAGAAATATTAA
GAGTAATAGTCTTTATGAAATGGTTCCTGTTATTGTTATTTCTCAGATAA
CCAGAAAAGATATTATTCAAACTTTTATTGAAGAACAAGTTGATGATTAT
TTCTTTAAAAGTTTGGATTTATTGGTATTGGATATTAGAATAACTAGTTT
TCTTAAAAAGAAAAAGGTGATAGAACAGGGACAAAAATATTTAGATCTTG
TTTTGCATGGTAGAGAATGTGTTGAGAGTGAGCTTATTGAGGCTGGAAAT
TATATTGAAAATTTATTACCCAAGAAGATCCGAAACGAATTTTTTCATTC
TAATTGGATCTTTGTTCCATCAAAAAGAATAGGGGGTGATTTTTTTAATT
ATTATTTTGTTAATGATGATAATTTAATAATTTATTTAATAGATATTTCT
GGGCATGGAGTGGGTTCTGCACTCTTATCCCTTAATGTTTCAAGTGTTAT
TAATTCTTATGTTATGAATAATAATGACATTAGTCCTTATAAGGTATTAA
ATTATGTTAATACTTATTTTGTAAAATTCAGAAGTGATATGTTTATTACG
CTATGGTATGGTGTTTTAAATGTAAAGACTAAACATTTAAGATTTGCATC
AGCAGGGGCACCTCCTGCTGTTGTTTTGAGTGAAAAAGGTAATGTTTATC
TTAAGACTAAAGGTGCCATTCTTGGAATTGAAGAAATGTATCCTTGCAAG
GAGAGTGAATGTTATTTGAATAAATTTTCACATCTGTTACTTTTTAGTGA
TGGTGTTTATGAGATTGAAAATAATCAGGATATAATAATGTCTATTGATG
ATTTTTATAAAATATTAAAAAAAAATACATTAAATCTAGATAGCTTTGTT
TTAGAGCGTTTGTATAATAAAATGTTAAATTTGTCAAAATATAATGTATT
TAGAGATGATTTTTCTATTTTAGAGTTTATTATTTATTAG
>BDU_353 transcription factor, putative
ATGTCATTTGTATTAGATCAGGCTGTAGTGTATCCAATGCAGGGAGTAGG
CAAAATAAAAAATATTCAGAATAAGGAATTTAATGGTGAATTTATTGATT
ATTATGAAATATATTTCCCATTTAATGAGATGACTTTCATGGTTCCAGTA
GCTAGAGCTGCAGATCTTGGAATTAGAGCTTTGGTTAGTAAAGAAAAGGT
AGAAGAAGTTTTTGATATTATTAAGGATTTTGAGGGGCAAATAGATCAAA
AAAAGATCAAAGATGGTAGTCATGATTTTTATAAGCAGAGTGATATATTA
AGTACTGCTAAGTTATATAAATTTTTGTATGTAAAATCTATGCAAAAAGA
GTTGCCTTTTTATGAAAAGAGAATTTTAAATGATTTTGAATTAATTTTAC
AACATGAGATTAGTTTAGCTTTGCAAATTAGTTTTGAAGAAGCCAAAGAA
AAGATTAGAGAAGTTCTCTCTGGGGGGCAGTCTTAG
>BDU_526 pantothenate kinase
TTGATGAGTAAAATTGTTGATTCAACTCAGTTAATTGTTGATATTGGAAA
TACAAGTATATCTTTTGCGTTATATGATGTTGGAGGCATGCAAATATTTT
GTAAACTTAAAACAAAACTTGATTTAAGTTTTAGAGAGCTTTGTAACTTT
CTTAAACTCAAATTTAACTTTAAAGTTAGTAAAGTATTTGTAAGTAGTGT
TGTACCAGTTATCGATAAAGTGCTTATTGATGCAATTATTTTTCTTTATA
ATGTGACTCCTTTATTTATTGGTTATGATTTAAGTTATGATTTAAGTTTT
GAATTTTATAATGGTCGTAAGTTTATTTTAGGATCAGATGTTTTTGCAAA
TCTTATTGGAGCTATTGAATATTATAATATTAATGATGCTTTGATTGCAG
ATCTTGGCACAGCTTGTACTATTTTTGCAGTTAGTAGAAAAGATGGCATA
CTTGGAGGTTTAATTAATGGTGGACCTTTCACAAGTTTGACTGCATTAAT
TGAAAATGCATATCTTTTAAAGGATTTTAATCTTGTAGTGCCTCAAAATT
TATTGGGTTTGTCAACTATTGATAGTGTCAATAGCGGTGTAATTTATCAG
TATAAGTATTTAATAGAAGGTGTTTATCATGATCTTATTCGTAATTATGA
TAGAGAATTTAAATTAATAATTACGGGGGGAAATTCTAATTTGATTTTAC
CTTTAATAAGTGTAGATTTTATATTTAATTTATATTTGACGCTTGAAGGC
ATTAGAATTTTGGGAAATGCTTTTAAAGAAAATCATTTGTCTTAA
>BDU_734 uncharacterized conserved protein
ATGTTAATAGATTTAGAACAAATAAAAATCAAAAAACGAATCAGAAAAAA
TATAGGAGATACAACAACTCTTAAAGAAAGCATTAAAAAACATGGGCTGA
TTTATCCTATAATAATAGACAAAAATAAAAACTTAGTGGCAGGTTTTAGA
AGATATCAAGTATTAAAAGAACTTGGATATAAAGAGGTCGACGTCAAAGT
AATTCCAATAGAAGATAAAAAAAGATTACTTGAAATCGAACTTGATGAAA
ATAATGTCAGAAAATCATTTACAAAAAGTGAAGCAGAAGAAGGTGAAGAA
GAACTCAAAAATTATTCAGAAAAAAACAAAATAATCAGATTTATAAAAAA
AATAATAATAAAAATAAAAAAAATAATAATAAAAATAAAAAAACAAAATT
AA
>BDU_788 uncharacterized conserved protein
TTGAGGAGAGAATTATTTTTTTTAGTTCTAATCATTTTAATAATTCTTGG
TATTGTAATTTTTTTTGTTGATATTTCTAAAAGAGAGCAAATATATTTTG
AACTAAATACCAAAAGCAATATTAGCTTTTTATTTCTTGTAGAAGATGAT
AATGAAAATCTTTTAAGTATGCAAGAAGTTTTTATTAACATAAAGACAGG
AAATGTTGGATTTTTGGATATTCCTATTTATACAGGTTATGAAGATTTTA
AAGGAAATATTTCGTGGTTTGAGGCTTTGTATAAAAAAAATAATTTTACT
GAATTTTTAGTTAAAGTATCTAAACAATTGAATCATGAACCTGATTATTA
TATTCGTTTTAAAAAAGATAATTTTGTGAGGTTTGTTGATTATCTTGGTG
GAGTTCGATTTCTTGTTAGAAATCCTGTTAAGGTATACAATTTGGTACAC
TCTATATTAATACCTTCTGGTAATTCTATTTTTGATGGTGATAAAGTTTA
TGATTATTTAAGTTATTTCAGAGATATTGCTTCTTATGATGAGCGATTTG
AATTTTATAAAGAATTTTTTAAAAAAATTTTAGCACAATTTGCTAATTTT
CAAGAAGAATATGATTATTTTTCTAAAATGTATGTTATGTTAGATACTAA
TCTTTCTGAAACTGTATTTAAATATATTCTTTCCAATTATAAAATAAATG
ATGAGAAGCTTATTTTTTTTAATATTAAGGGTCAAGAGGAAACATTTAAA
GATGATGATGATAATTTAATAAAAGTTATTTTTCCTTATTATGGGGGAGC
AGTTCTTAAGGAATCAATAGAAAATTTGAATAGGATTTTAATAGATGGAA
CTAAAACCGAAGATGTAATTAAGATTATTATTTTAAATGGCACACAAACT
GCTGGGCTTGCAAGGAATGTAGCAGATATTTTTAAATCTTTAAAATTTAA
GGTTATAAGATTTGGAAATGCAGATAAGCATAATTATTCTAATACTCTGA
TTATAAATAATTCTGATAATTTGGAGATTGCTATTAAGGCTGGAGATGTT
ATTAGAGCGAGAAATATCAAGCCAATCTCTGAGTTTCATATGGATATTTT
GGGACTTGATATCTCTGATATGGGTCCTGATGTTGTAATAATTTTGGGAG
ATGATTTTGATGGAAGATATGTTAAGAGTCGATGA
>BDU_346 fibronectin/fibrinogen-binding protein, putative
ATGTCATTAAACTATCACGAAATAAACATTTTGCTTGAAGAATTGCCATT
AATAAATTCATTTTTAAAAAAAATAAAACAACCTAATTACAAAAACTTGG
TTATAGAATTTTACAATAAATCAACAGATGAAAAAAATTTTAATGTATTA
ATATCTCTAGATTCACAAAAAACAAGAATTCACAAAACAAATAAAAAATT
TGAAAATATCAAACCTCCTCTAAGATTTTTTGAATTTTTAAAATCAAAAG
TCACAAATGGCAAAGTATGCGAAGCACATCAAATAAAAAATGAAAGAATA
ATTTTAATAAAAATAAATAAAAACCAAAATTATTATTGTATTTTCATAAA
ATTATGGGCATCTTCTCCTAATATAATTGTCACAGACACAAATTTTAAAA
TTCTTGATGCATACTACAGAAGACCAAAATCAAAAGAAATAACAGGTGAA
ATATTTACAAAAGCCAAAAAAATTATTGAAAATAACGATATAACTGAGAA
AAAAGAAGTCAAACTCAAAAATGAATATGACAATAAATTACCATACTCAA
CATTCATTGAAAATTACTATGACAACTTAAAAATAAAAGAAACTAAAACA
CATAATACAGAAATGTTTAATAAAACATATGAACAAGAAAAAATCAACTT
AGAAAGAAAAATATACTCTCTAAACAAGCAATTAATTTCAATGGACATAA
TAGAAACTCATAAAGAAAAAGGTGAAATGATTTTATCAAATATAAACAAA
ATTAAAAAAGGAATGAGTGAAATTACTTTACAAAACAACAATGGAGAAGA
AATTAAAATAACATTAGAAAAAAAATTATCTCCTCAAGATAATGCTTTAA
AATATTTTAAAACATACAAAAAAAACAAAAATTTTCTTAAGATTGTACAA
GAACAATTAAAAAATGCAAAAACACAATATAACACATTAATATCAAACAC
AACTTATACAAAAGAAAAAAACCATACAACTCTGACTGATGAAAAAACAA
CAAAACAAAAAATCATTAAAAAAACATCTATTGGGCTCCATTTTATATCT
CATGGATTTGAAATTATTGTGGGAAGAAATGCAAAAGAAAATGACGAACT
ATTAAGAAGTTGGGCAAAAGGAAATGATTATTGGTTACATACAAGAGATT
ATCCTGGTGCTTATGTATTTATTAGAAATAAAAAAAACAAAACACCTCCT
CTTGAAGTTTTAATAGATGCTGGTAATTTATGTGTATTTTATACAAAGCC
AGCAAAACAAGCGGGAAAAGCTGACCTTTACTATACCAATGTCAAATATT
TAAGAAAAATTAAAGGAGAAAAAAAAGGACTTGTAATACCTCACAGAGAA
AAAAATTTAGACATCAAATTAGATCTCAAAATATTAAACAAACTTAAAAA
CAAAAATTAA
>BDU_136 greA, transcription elongation factor EF
ATGTCTAATATTACTATAGAAAGATTAGATAATATCTTGCAAGAGGATAA
ATGGACAAGAATAGTTGTTAACAATTATTCTCTTGCTAAGATAAAGGAAT
TGGATGAGTTAATAGATAATATAATTTCTGAAAATTTAACAGAAGAAGCT
TTGGATATTTGTGGTAAGCATTTAAAAGATATCAAGAAAAGTATTGCTGG
TCTTTATATTTCAGGAATGCTTATATATAGTAGAAGACCACTTAATGATA
TGAGTTTGCTTACAGTTGTAGATTTGTTTTCTCAGAACTTAAAGTGGTCT
CTTGTTGAGCATATATGTCACAAGATGCTTTTAACTTCTGAGAACAAGCA
TGCACTCTATACACTTGCAAAGATATATGCACAAAATAATGAAAATGATA
AGTTGCCAAGTATTTGGATGCGTATTGTTGAAGCTGATGTTGATGATACT
GTTTTTGTAAGACAACTTGCTACTCATTATGAGAATGTTGATTTGCAAAA
ATCAATATATTTTTTTAGAAAGGCTATTTATCGTTTTATAGATAAAAAAC
AAATGTCAGGCATTAGAGAAATATGGTCTAAATTGATAAGATATGTCTCT
GATGATTTTGATTCCTTTTTGTTAATCCTTCAGAAAGTTGAAAAAGAACT
TGGTTTTAAAAAGGTAGTGGTTCTTTATGAAGATTTGTATGAACATTATT
CTGTAAGTGGCAATATCGATGAGACAATAGAAATTTTAAAAGGAATTTTA
AAACTTGATAATAAAAATCAGAAAGCAAGAGAAAATTTAGTGATTTTTTT
AAGAGAAAAGTATAAGGATGTTAATAATATCGAAGAGTATCTTGAAAAGT
CTGATATTGAAAATTTAGATAAAAATTTTGTTGATGTTTATTCTGATTTT
GAAAAATATTTGTTTTTTGCTAAAGGCAATTTTGTTTATCATCAGACTTG
GTTTGTAGGAATAGTTAAAGATGTAAATGATCAGGGTATTTTAGTTGATT
TTGTATCTAAACGCGGACATTTTATTAGTTTTGATATGGCTATATCTGCT
TTATCTCCTCTTGAGAGGGAAGATATTAGAGTTTTAAAGGCTATTAAACC
TAAAGAAGAGCTTGTTGAGCATCTAAAGAGAGATATTGAATGGGCGTTAA
AAGTAATTATTAAAAGTTATAAGTCGATTGATCTTAAAGGGATTAAAAGA
GAACTTGTTCCAAGTTTGATGACTCAGAGTGCTTGGAATTTATGGAGTGT
GAAAGCTAAACAAATTTTAAAAGATAATCCTCATTTTGTTATGGCATCTG
GAAAAGCTGACTGTTATATATATAATGAGCGAGCTTCTAATTTTAATGAA
AAGATTTATGATAAGTTTAAGGTAGAAAAAGATTTTTATAAAAGATATGA
AATTTTTATGCATTATTATACTTCTGGTGGTATTGTAAAAGATTCACATA
TTGAAGAAGAAATGTTAAATTATTTTTTGATTTATGTTAATAATTTTGCA
AAAGTTGATCATTATGTTATAAGTTCTTACGTAATACTTAAATCTTTAAA
AGATTTTGATGATAAGATTGCTTTAAAAATTAATATTGAAAGAGATATTA
ATTTAGAAGTTCTCTTGAAGGAATATTCTAAGAGTATAGTTGATCTTTTT
GATGCTATTTTGAATGCAGATATTAAAAAGGAATTGATATCTTTGATTAA
AGAAGAATTGGTTGATTGGGTTGCTTATTATAAGCAGCTTTTTCCTTGTT
ATGTGAATAAAAAATTAATTGATTCTCTTTATAAAGAAGATATAAAAGAA
ACCGAACATCTTTTTAATTATGTTACCAAGAATTATAAGATGTATAAAGA
TGCTTATATTTGGATTTTAAAACATTATACTTCTTATTCTCTTAATTTAG
ATTATTCTGATGCAGATTTATTGGTAAATTTGATTAAAATTTTAACAGAT
AGTGTTATTAAGATTAATAATAAAAATAATTCTGTTGCTAATAAGCGGAT
TTATAAGATGGTAAGTAATCTTTTAATTAAAGATAAATATCTTAGTATTG
TTTTAAGTAATGTTATGGATGAGGAACTTGCTAAGAGGATATATATGACT
TGTTTTTACATAAGAGATTTTCCGCCAAAAGATTTAATACATATTAAAAC
TGCAATAAGAACTGTATTTGGTAATATTGAATTTGAAGACGAGAAGATGC
AAGTTTCAGGAGATAAGGTTGAGATAGGATTTTTAACTATTTTAAGTTCT
CTTAGCAAAAAGCAAAAAGAATTACAATATTTAAAAGATGTAGAAATACC
AGAAAATTCGAAAGAAATTGGTAAGGCACGTGAACTTGGTGATTTAAAAG
AAAATGCAGAATATCATTCTGCAAAAGAGAGACAACAGTTTTTAACAAAG
AGATTAAATACTCTTATGTCTGAGATAGATGTTGCTAAGGTTATTGATAT
TAAAGAACTTCAAAGTTCTGTTGTTGGATTTGGAACGAAAGTTACTATGA
TTAATAAAGATACGGAACGAGAGGAGTCTTATTTAATATTTGGTCCTTGG
GAATCAAATCCTGATGAAGGTATTATATCTTATAAATCACCTTTTGGAGA
AAATTTGTTAGATTCTCGGGAAGGTGATAGTCTTGATTTTGTTATAAATG
ATACTCATTTTCAATATTATGTTAAGAAGATAGAGCCTGCCAAAATTAAT
TGA
>BDU_627 mfd, transcription-repair coupling factor
ATGAATATAGAAAAAGAATTGACCACCAAATTAAAAAACAATCAAAATTT
ACAAAAAATGCAAAAATTTATTGAACAAAATATACATTTTACACTAACAG
GATACGAAAAATTTTTTAAAGCTTTCTTAATTCACAAAATAAAAAAATAT
AGTAATAATAAAGTTATACTAATAGTTAAAAATGAAAATATATCAGATAA
AATTAAAAATGATTTAACACAAATCACAGATCAAATATACGAACTTAATT
ACTTCAGCCCTCTTATATACAAAGGAATTGGCTCAAAAAGTAAAGTTTTC
TGTGATCGAGTAAAATTTTTAATCAACTTTTATGAAAATAATCCTGGCAT
ATATATTGTTTCATTAAAATCCCTACTTAGTAAAATTCCTACAAAAAAGG
ATCTATTTAATAACATATATAAAATCCAAACAGATAAAATAATTAACATA
GAAAATTTTGAAAAAAAACTTATAAAAATGGGATACGAAAAAACAATGAG
GGTTACATTACCCGGAGAATTTACAATAAATAACAAAATAATAGATATAC
ATTCATTTAATCACAAAGAACCAACAAGAATTTCACTTAATAATGACAAA
ATAAAGCAAATCAATTATTTCAATCCCCTAAATCAATTAAAACAAAAAAA
TGCTATTTATGAATTTAACATAATTCCAAAAAAAGAAATAATTTGGAACA
AAGAAAACATAGATAAATTAAAAAACTACATCAAAGAATCTGAATATAAA
CAATTCTTTAAACAAATTGAAACAAAATACAACGCAAGAACAGAAGAAGT
ATTTTATCCATTCTTAGGAGAGACTCTCTTAAGTCAGGAAATAAATGAAA
ATACAATTACTATAAATTTTGAAATACCAAATTTAAAAGAAGAAATCAAA
CAGATATATAAAGAATACGATAGGCTCTACACTCAAGCAATAGAATCAGA
CATAAAAATAGTATCACCAAAAGAAATCTTTATAAATCCCAACGATTTAA
AATTAAAAAGCAATATATATTTTATAAAAACTCCTATAAATCAGCAAACA
GAAAAGCCTACAAAAGAAATTATAGAATTTAAAATTGAGAGCGAACGTAG
ATTTTTTTCAAATATTGTACTTGCAAAACAAGAAATACAAAATTGGATTG
ATAATGGATTTCAAGTAATTATTACAGCAGAATCCAACTCACAAAAAGAA
AAATTAAAATACATTTTTCAAGACATACCTAAAATCAAAGTTGAAGTTAT
TAAGATATCAAGCTCTCTTATAATAAACGAAGAAAAAATAGCTATTATTA
CTGAAGCAGATATTTTTAACAAAAAACAAAAAACAAATAAAACTTTCGAA
TCATCAAAAACAAAACCTATAGATTCATTTATTGAGATTGAAAAAAATAG
TCATATTGTCCATATAAATCATGGAATTGGAATATTTAGACAAATAAAGA
GAATCAAAACAAGTCTTATTGAAAAAGACTATATTGAAATTGAATATGCT
GATAATGAAAAATTATTTATTCCTATTGAACAAACACACCTTATTCAAAA
ATACATTGGAAATGAAACTCAAAATATAAAACTAGATAGAATCAGTTCAA
AAACCTGGGAAAAGAAAAAAGTTTATGCAACAAAAAAAATTGATAAAATT
GCAGATCAACTTGTTTCACTTTATGCAGAAAGAGAAAATATTACAGGATT
TCAATATCCTCAAGATGATGAATGGCAATTATTATTTGAATCAGAATTTC
CATATGATGAGACTCCAGATCAATTAACAGCAATATCAGAAATCAAACAA
GATATGATGAGTTCAAAAGTAATGGACAGACTTTTATGCGGAGACGTTGG
ATTTGGAAAAACTGAAGTTGCAATGAGAGCAGCATTTAAAGCTGTTATGG
GGAAAAAACAAGTAGCAATACTATCTCCAACAACAATTCTTACAGAACAA
CACTTCAATACATTTAAAAAAAGATTTAAAAATTTCCCAATCCAAATTGC
AATGATTAGCAGATTTATAACAAAATCAAAAGAAAAGGAAATTCTTCGCA
ATTTAGAAACAGGAAACATTGACATAATAATTGGAACACATAAGATACTA
TCAAAAAAAATAACATATAAAGATTTGGGTCTCATTATTATTGATGAAGA
ACAAAGGTTTGGTGTTAAAGAAAAAGAAAAACTAAAAGAAATAAAAGTCT
CTGTCGATTCTCTTGCATTATCAGCAACTCCAATTCCTCGTTCTCTTCAC
ATGTCATTAATAAAACTAAGAGACATTTCTGTTTTAAAAACTCCACCCCA
AAACAGAATTAAAATAGAAACTTACGTTGAAGAATTTAGTGAAATATTAA
TTAAACATGCAATCGAAAATGAACTATCAAGAGATGGACAAGTTTTTTTT
GTACACCATAATATTCAAGAACTAGATTCAATAAAAGCAATGATAGAAAA
AGTAGTCCCTTATGCAAGAATTGCAACTATCCATGCAAAACTTACGGGTG
AGCAAATTGAAAACATTATGCAAGATTTTATAAATAAATCATATCAAGTA
TTACTAGCAACAACAATTATTGAAAATGGAATAGACATTGAAAATGCAAA
TACAATAATCATCAACAATGCAAATAGATTTGGGCTTGCACAATTATACC
AACTAAGAGGAAGAGTTGGCAGAAGTTCAAAAAAAGCATTTGCTTATTTT
TTATATAAAGAAAATTCAAATCTCAATGAAGGTGCCATTGAAAGACTAAG
AGCAATATCTGAATTTTCAGAACTTGGAGCAGGATTTCAAATTGCAATGA
AAGACATGGAAATAAGAGGCGTTGGTAATTTACTTGGAAGAGAACAACAC
GGAGAAATTGAATCTATTGGACTAGATTATTATTTAACAATGCTAAATAA
AGCAATTGAAAAACGTATGGGAAAAAATTCAAAAAAAAACGAAATCAACA
TTGAAATTAATTACAATGGATTTATCCCTAATAGCTATATAAATAATGAA
CAACATAAAATATCAATTTACAAAAAAATTTCAGCAATTCAAAGTGAAGA
AGAAAATAACAAAATAAGATCTGAAATTTATGATCGATTTGGACCAATTC
CTAACGAACTAAATAGCCTACTTATTTTATCGGAACTAAAATTACTTGCA
CAAAAACTCAATATTACAAGCCTTAAAGAAAGAAATGGATTACTTGAAAT
TGAATATTTAGACATAAATAGCATTCCTGCAGAAAAGATCATGAAAATTA
TTAAAGACAATCCTAATATCTTAAAATTAAATCAAGAATATCAAAACTCG
GTTTTTTTAAATTTAGGAAATATTAAAGAAACAGATAAAATAAATTGGAT
ATACAAAAATTTATATCTATTATTATAA
>BDU_449 ntrA, RNA polymerase sigma-54 factor
ATGCTAAAACAAAACTTAAAATTAACACACAAATTACAATTAACACAAAT
TAACACAATTAAAATGTTAAGTCTTGATAAGCAAGAATTAATACAAATTA
TATCAGACGAACTTGACAATAATGAATATATTAAAGTGGATTCAAATAAA
ATCTTTTTTGAATCACTAAAAACCTATAAGTTTAAAAAATTTTTTTATAA
AGAAAATGAAAATAACAAAACACAATATGAAATTGCACTGGCTAAAACAT
CACCTAAAATTTCACTTAAAGAACATCTTTTATTACAACTTAGAATCCAA
AGACTTAATGAAGAAGAAATTAATATAGGAGAAATCATAATAAACAATCT
AAATCGAAAAGGACTATACATAATCAATCCTTATGATTTCTTTAATAAAG
AAGAGTGGCCACAGGTCACTAAAATGATCAAATTGATTCAACAATTTGAT
CCAATAGGAATTTGCGTACCCAATATCATAGAATCATTAATATTACAAGC
AAAATACCATAACTTAGATACAAATATAATTAAAATTCTTCAAAAAGCAG
ATTTACTTACAAATACTAAAGAAAAATTACAAAAAGAATTAAACATTAGC
ACACAAGATTTAAATGACGCCATTAACACAATGAAACTTAAACTTAATCC
CAATCCAACATTTGAATTTAAAGACAAAGATGATACTAATGACTATATTG
AACCAGATATTATTGTTATCAATAAAGGCAATAAACTCAAAATCAAAATT
AAAGAAGTCAGTATTTTTAAAACAGAAATTAATAAACAAGAAGTTAAAGA
CTTGTGCAAATACAAACAAGCAAAATGGCTCATTGAAGCTTTAAGATATA
GAGATGAAACACTAGCTAAAATAGGAATAGCAATATACACATTACAAAAA
GAATTCTTAAAAAGAGGATTTAAGAGATTAAGACCAATGAACTTAGATGA
TATATCTACAAGAATCAATCTATCAAAATCAACTATATCAAGAGCAATAA
AAAATAAATATTTAAAATTTGACTGGGGCACAATAGCAATTAGAAAATTA
TTTAATTCAATAGGTGGTGCTAAAACAAATGAATTTTCCAAATTAAGCAT
TAAAATAATAATAAAAGGAATACTAGCACAGAATAAAAATATGGTAGATA
GTCAAATTTCTGATATACTAAAATCTAAAGGAATCACTATTTCAAGAAGA
ACTGTAAACAAATATAGGAATGAATTAAAATGTGAAGGAGAAATTTATGG
AACCTAA
>BDU_808 nusA, N-utilization substance protein A
ATGTTAAGAAGGCTAAATTGTCTTAAAGGAGTCTTGGATATGATAAAGGG
TACTGGTCAAATGATTGCCAATATTGCTAGTGAGCGGGGAATGAGTATAG
ATGCTATTAGAAAGACGGTTAGAGAATCGGTAATAATAGCTTATAAGAAA
TACTTTGGAACAAGTGATAATGCTTTAATTAAGTTTGATGATAATACTGG
GGACTTAATAGTTTATTCCAAAAAAAGGATTGTGGATGAAGTTAAAAATA
ATGTAATGGAGATATTAGTAGATGATGCTAAAACATTTGAAGTTGTAGAT
AATGAATATGTTTATGTTGAAATTAATCCTAAAATTTTTGATAGACTATC
AATTCAGGTTGCTAAACAAAGAACTAAGAGTGATTTGCAGGGAATTGAGG
ATAATGAACTTTATTTAGAATTTAAGCATAAATTACATAAAATTGTTATT
GGTTATGTTCAACAAAATAGAAATGGCGATCTTTATGTTAATCTTGGTAG
TACAGATGGTGTTATTCCTAAGAAATATCAATCTCCAAGAGAGGTTTATA
GTCTTAATGATAAAGTGCGAGTTCTTGTTTATAGTGTTAAAAAAGGAAGG
AATGGGATAGAGGTAATTTTATCAAGAACCCATCCTAAATTTATTGAAGA
ATTACTTGCTCTTGAAATTCCTGAGATTGAAGAAGGGATTATTAAGATAC
ATAAAATAGTAAGGGATCCAGGTTATAGGACTAAAGTTGCTGTTTATTCT
GAGAAAGAAGAAGTTGATTCTGTAGGTCCTTGTATTGGACAAAAGGGAGT
TAGAATTCAATCAATAATTAAAGAACTTGAAGGAGAAAAAATAGATATTA
TTCCTTATTCTAAAGATATTAAGGAGTTTATTAAGGATTCCTTAACTCCG
GCTAAGATAGATAATGTGTATATTATTGATGAAGATTTGCATAAGGCATT
AGTTGTTGTAAGTGATGATCAGCTTTCGCTTGCAATAGGTAAGATGGGAC
AAAATGTTAGACTTGCAAATAGACTTCTTGATTGGGCAATTGATGTTAAA
ACTAATAGTCAATTTGCTGAAATGAAGGCAAGTGGAGAGTTTAAGCAAGA
TACTTTTGAAATGTTTGACAAAATTATTCAGGATAATGTTCAGGAAGATG
AATTTGAAGAGATAAATAAAATTAGTGAACTTAAAGTTCTTGATGATGAT
ATTGTTGCCAAATTGATTCAAAGAGATCTTGATGATATCGATAATTTTTT
GAATGCCAGCGAAGATAAGCTTTTTGAGTTAGGAATAACTTATGAAAAGC
AAGAAGAGATAAATAAAATATTAAAAGAAGGAATGGTAATAATTTCTAAT
GACGATGAATCTGTTGAAGATGTGAAAGATGAGGAAGATTTACTTTGTCC
TGAGTGTGGTGCTGTTATTAATGAAAATATGACTTTTTGTCCAGGTTGTA
AGATAGGGCTTAGTTTTGAATTTGAAGAGGAGTAA
>BDU_110 nusB, N-utilization substance protein B
TTGGTTATGGATTTGAGACATAAGGCTAGGGTTTTAGCTTTTCAAAAAAT
TTACAGTATTGATGTTAACTGTAAGGCAAAGGATAATATTTTTGATATTT
TTAGTTTTGAAGAGAATGGGATAGATTTAGATGGAGATTTAAAGTTATTT
TATTCTGTTCTAGTTAATGGTACTTATGATAATTTAGAGTCTATTGACAA
ATTAATTAGTGGTATTTCACTTAATTGGCGTTTGGATCGTATGGATAAGG
TTGATCTTGCTATATTAAGAATGAGTGTATATTCACTTAAGTTTCAAGAT
TTAGATGTTCCTAAAAGGGTTATAATAGATGAGGCTATTTTGATTGCTAA
AAAATATGGCAATAAAAATTCTGATAAGTTTGTCAATGGTATACTTGATG
CTTTGTTAAAAGATATGGAGAGTTCTTTTGAAAACAAATAG
>BDU_388 nusG, transcription antitermination factor
ATGTCTAGGGCCTGGTATGTGCTACAAACTTTTTCTCAGTATGAGAAAAA
AATAGAACAGGAAATAAAGCTTTTAATTAGTGAAGGTGTTTTTGGTAATA
ATGTTTTGGATGTTAAAGCTCCTATTGAGAGAGTAGAAGAGATAAGAAAT
GGAAAGAAACGTATACGTGAGAGAAAGATTTGGCCAGGGTATATATTGAT
TGAATTAGATCTTTCCGATCAGGAGTGGAAAAGTACTGTAGCTAATATTA
TTAAAATATCAGGTGTTGTAAATTTTGTTGGTACTACTAAAGAACAAAAA
CCTCTTCCAATTAGTGATGAGGAAGTTAAGAGTGTCTTTATGCTTGCTGG
AGAGATTAAAGCAGATAAATCTATTTTTATACTTTATGATTTTGAAGAAG
GTGAGAGAGTAAGAATTAAGGGAGGCCCTTTTGATTCTTTTGAGGGTGTT
ATTGGATCCATTGATTATGAGAAGAAAAAATTGAAAGTTGCAGTTCAAAT
TTTTGGAAGGTCAACTCCTGTTGAAGTTGATTTTCAACATATAGAAAAAA
TTTAG
>BDU_584 recG, DNA recombinase
GTGTTTTTGCATGAATTTCAGTATGGCTTACAAGGCATTAATGGTCTTGG
CAGTAGGGGAATTGATAGATTAAATAATATTAGAATTACAAATGTTAAAG
AGCTAATAGAATATTATCCAAAAAAATATGAAGATCGTAAAAATATGGCA
GCATTTCCAGATCCATTACAAGTTAGAATTTGTGAACTTATGACGATTTT
TACTGTTATAGAACATAGAGATTTTGGAAATACTTTTAAGAGAAATTTAA
AGATTATAGGTAGGAGTGAAAATAGTGAGTTATTTGAAATTCTTTTGTTT
AATAGGAGTTTTTTAGAGCGAATTTTTAAGATAGGTCAAAAGTTTTATAT
TTATGCTAGGTTTAGTTATAACGATTATACTAAGATGTGGAGTTGTTCTA
ATTTTGATAGTGAGATATTTAGTTATAATCCTGTAAAATTTAAAAAAATT
ATGCCTGTTTATTCTCTTAGTGAGGGACTTAGTTCTAAAAAAATATCTTC
TTATGTGAAAGGTGCTCTTGCGTATTTTGTAAAATTTGGACAATCAGATA
TTCCTAAATTTTTGATAAATAAATATTCATTATTGTCTTTGCATGAAGCT
TTAAATGAGATTCATTTTCCAAGTTCTCTTGAAATGCTTAGGAGAGCAAA
AAAAACTTTAGTTTATAGAGAGATTTTTTTACTTCAATTTTTTTCAAGGG
GTAAGAGTTATAGGGTTTTCTTAAGAGCAGAAAAAAATTTATCTAATGAT
TTGTTAAAACAAATTATTTCAAAACTTTCATTTGAACTTACAAGGGATCA
AAAAATTGCAATTACTGAAATAATTAATGATCTTAAAAATAACAAACCAA
TGAATAGACTCTTACAGGGTGATGTTGGAAGTGGTAAAACCCTTGTTGCT
TTTCTATCTAGTATTCCTTTAATTGAAGCTGGATATCAAGTTGCATTTAT
GGTGCCTACTGATCTATTAGCACGTCAACATTATAATAGTTTGACAAATA
TATTAAAAGATTTTGATATTTCTGTGGTTCTTTTGACTGGAAGTTTGAAA
AAAAAAGATAGAGATGAGGTTTTAGAAAAGATTCAAAGTGGAATTTGTAG
TTTGGTAATTGGGACTCATGCTATTTTTTCTCAAGGGACAAAGTTTAAAA
ATTTGGCTTATGTCATTATTGATGAACAGCATAAGTTTGGAGTTGAACAA
AGAGAAGAGCTTAGAAATAAAGGTGAAGAAGTTGATGTTCTTTTAATGTC
AGCAACGCCTATTCCTAGAAGCTTAGCTTTAACCCTTTTTGGAGATCTTG
AAGTGTCTTTAATTAAAAGGGGTCCTGAGGGTAGACTACCTGTTACTACA
TATTTGGCAAAACATGGCAATGAGGAAAAGGTATATGAATTTTTAAAAAA
TGAACTTGGAAAAGGACATCAGGTTTATTTTGTATATCCTTTAATATCAT
CTTCAGAAAAGTTTAATCTAAAGGATGCTACTAGTATGTGTTTAAATCTT
CAAAATATTTTTGTTGAATATTCTGTTGCTATGATTCATTCTAAGCTTGA
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TTTTGCTTTATAAGGAACCTTTAACGGAAGCAGGTAAATTTAGACTTAAA
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ATTAAGAGGGCCTGGAAATTTATTTGGTCTTGAACAGAGTGGCTATTTCA
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AGATGTTAAGTTGCTAGATAGCCTTTTAGTATCATATTTAAGTTCAGTTT
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>BDU_230 rho, transcription termination factor
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GCTATTAATATTAAGAAATCGGGGACAAGGAAAGAAGAATTACTTTTAAG
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TTGATGATTATGAAGGAGTTGAAGCTTTGGTTGAAAAGATGAAAAAGAGT
AAAAACAATGAAATTTTTTTAAAAACCATGAGTAATGGAGATTAA
>BDU_707 rnc, ribonuclease III
ATGGGTTCTTCAGTAGTGAAGTTGGATGTGGATCGAAAACAAAAGTTAAA
TGAGTTTTTAATGGGTCTGCATATTGATTTTAATGACATTTATTTGTTAA
ATATGTCTTTAAGTCATTCATCATATGCAAATGAATTTGATCAGAAATAT
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TATTACAGATTATTTGTATAAATTTTATCCTGATAAGAGTGAAGGTGAGC
TTAGTAAAGCTAGGTCTTATATTGTTAGTGAAGATTCTCTTTCTAGTATT
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TGATTTTAAAGATTATAAAAGTTTATTGCAAGAATATGTTCAAAAAAAAT
ATAAAATTTCACCAAGTTATAAATTGGCTAAAGAATTAGGTCCTGATCAT
AATAAGATTTTTTGTGTTGAACTTTATGTTAATGATAAATTTGTATCTAA
TGGCAAAGGAAAGTCTAAAAAAGAGGCTGAGATGATAGCAGCTGAAATGG
CACTTAAAAATATTGTGAATATTGATCTTTAA
>BDU_505 rpoA, DNA-directed RNA polymerase
ATGTCTTTAGGAAAGCTTTTAAAAGATTTTACTATACCTGATAGGATTGA
ATTTGTGAGGGGAGAGGATGATGGCTCTTATGGAAAATTTATAATATATC
CTTTTGAGAAAGGTTTTGGTGTTACTATTGGAAATACTTTAAGACGTGTA
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CATTTAAAGTTGGATGAAGGAGTTACAAATACAACAATAAATCTTTCTGT
TAATGGGAAGGATAATAATGTTTTAAAAGCAGGTCATCTTGAGAGAGAAG
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AGAGTTGGACAGAGATCTGATTATGATAAACTTGTTATGGAAATTTGGAC
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TAAGAGAGTTTTTACTTCCATTAGTTAATTTTGAAGATAAAGTTATTCAT
TCTGTTGATTATGCTGAATTTAGAGATTCTGACATACTTAGTATGAATGT
TGAAAAATTAAATTTGTCTGTTAGATCTCTTAACTGTTTAATTAAGGAAA
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TAATGCTTATGGGTTATTTTTGGGAATGTCTAAGGTAGAAGCTCTTAAAG
TATTAAGTAAACACGATAAAATATCTCATTAA
>BDU_383 rpoB, DNA-directed RNA polymerase beta chain
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CTTACCTAACCTAATAGAAATACAATTGAATTCTTATGAAAAATTTTTGC
AACTTGAGAGATTAAAAAATAATAAACCTTTGCTCAATGAGGGCCTTGAA
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TCTTGAATATGAAAAATATTATATTGAATATGATTCTATTAGCTTTACTG
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AGATTAAACTTACAGTTTCTAACAACAGGAGAGATAAGACAAAAAGATGT
TTATATGGGAACTATTCCTTTAATGACAGATAGAGGAACTTTTATCGTTA
ATGGTGCAGAAAGAGTCATTGTATCACAAATTCATAGATCTCCGGGGGTT
GTTTTTTATAAGGAAAAAGATTTATATTATGCTCGTATTATTCCTTATCG
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TTAAGATAGACAGAAAAAAAAGAATATTAGTTACTCTTTTCTTAAGAGCT
TTAGGTCTTGATACTAGAGAAAAAATAATAGAGACTTTTTATAAGATTAG
AAAAATTGAAGTAAATGATGATACTAAAAGAGAGATTACAGGACAGTATT
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AAGATAACTTTGCAAGATATTGAAGACTTTTTGCAAAATGGAGTTAAAGA
AATAAACTTGATTGATTTTGATGGGTATGATAGTGTTCCTGGAAAACATT
TCATTAGTTCCGATGTTATTTTAAATTGTTTTGAAAAAGAAGATGCTTAT
TTTGCTTTAAAAGATGGATTTAAAGAGCTTTCACGAGAATCCGTGATGCT
TGCAGTTTATAGTGTACTTTTGCCTGGTGAACCAATATCAATTGACAATG
CTGAGAACGATTTAAGAACTGTATTTTTTTCAGAAAAAAGATATGATTTA
GGTCATGTAGGAAGATATAAACTTTCTAAGAAGTTTGGTCTTGATGATCT
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GGAAATAGAAGAGTGCGTTCTGTTGGTGAGTTACTTACAAATATATATAA
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AAGAAGTATTTAATTTGAAACCTCAAGAATTAATTAGTGTTAAGCCCGTT
GTTTCTGCTGTTAAAGAATTTTTTGCAACCAGTCAGCTTTCTCAGTTTAT
GGATCAGGTTAATCCTTTAGCCGAACTTACTCATAAGAGACGTCTTAATG
CATTGGGTCCTGGTGGACTCTCAAGGGATCGAGCAGGTTTTGAAGTAAGA
GATGTACATTATACTCATTATGGTAGGATGTGTCCTATTGAAACTCCTGA
AGGCCCAAATATTGGACTTATTGTTTCTTTGGCTACTTATTCAAAAGTTA
ATGATTATGGTTTCTTAGAAACTCCTTATAGGAAGGTGATTGATGGTAAG
GTGACCGATGATATTGAATATTTGTCTGCTATTGATGAGGAAAAAAAATG
TATTGCGCAAGCAAATGCTTCTGTTAGTTCTGATGGTAATTATACTGATG
ATTTGGTGTCTGTTAGGATTTCTGGTGATTATACTACAATGATGCCTAAA
AATATCGATTACATGGATGTTTCGCCTAGACAATTAATATCTGTCTCTTC
GGCGTTAATACCTTTTCTTGAACATAATGATGCAAATCGTGCTCTTATGG
GTTCGAATATGCAACGTCAGGCAGTTCCTTTATTATTTCCACAGCCACCT
ATTGTTGGTACAGGCATGGAGAGGATAGTTGCAAAAGACTCTGGTGTTGT
TATTAAAGCAAAAAGACCTGGTAGAGTTGTCTTAGCCACAAACAAAAAGA
TAGTTATTAAACCTGATAATGCAACTTCTGAACGAGATTTAGATGAATAT
GAACTTTATAAATATGAGAGGACAAACCAGGATACTTCTTTCAATCATTC
AGTTTTGGTGAAGAATGGCCAAATTGTTAATAAGGATGAGATAATAGCAG
ATGGTCCTGCTACTAGATATGGAGAATTGGCGCTTGGTAATAATTTATTA
GTTGGTTTTATTCCGTGGAATGGATTTAATTATGAGGATGCTATTTTAAT
TTCTGAGAGAATTGTAAAGGAAGATCTTTATACTTCAATTCATATTAAAG
AATTTAGCATTGAAGTAAGAGAGACTAAGCTTGGACCTGAAAAAGTTACG
GCTGATATTCCTAATGTTAGTGGAAAGATATTGAGTAAACTTGACGAAAA
TGGAATTGTAAGAATAGGGACTTATGTAAAACCAGGTGATATTTTAATTG
GTAAAGTTACTCCAAAATCAGAAGGAGATATTACCCCTGAATTTAAACTT
TTAACTTCTATATTTGGTGAGAAAGCAAAGGATGTTAAGAATAATTCATT
AAAAGTTCCTCATGGTACTGAAGGAACTGTAATTGATGTTCAAAGAATTA
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GTTTATATTGCCAAAAAAAGAAAACTTAAAGAAGGTGATAAAATGGCAGG
AAGACATGGAAATAAGGGTGTAGTTGCAAAGATTCTTCCTGTTGAAGATA
TGCCATATCTTGCAGATGGGACCCCTCTTGATATATGCTTGAATCCTTTG
GGAGTGCCATCTCGTATGAATATTGGACAATTGATGGAATCTCAGCTTGG
TCTTGCTGGTAAGTATCTTGGCGAATATTATGATGTTCCTGTTTTTGAGT
CTGCTACAAATGAATGTATTCAAGAAAAGTTAAAAAAAGCTGGATTTAAT
GAGACGTCAAAGGCAGTCTTGTATGATGGATATACAGGTGAACCATTTGA
AAATGAAGTTATGGTTGGAGTTATATATATGTTGAAACTTCATCATCTTG
TTGATGATAAGATGCATGCAAGGTCTACAGGCCCTTATTCACTTGTATCT
CAACAACCTCTTGGAGGAAAAGCTCAATTTGGTGGACAAAGACTTGGAGA
GATGGAAGTTTGGGCTCTTGAAGCTTATGGAGCTGCGCATACTTTGCAAG
AATTATTAACAGTAAAGTCAGATGATATGTCAGGAAGAGTTAAGATATAT
GAAAATATTGTTAAGGGCATTCCTACTAACGTATCTGGAATTCCTGAATC
TTTCAATGTTTTGATGCAGGAACTAAGAGGTCTTGGTTTTGATTTATCTA
TTTATGATGATAATGGAAATCAAATTCCTTTAACAGAAAAGGAAGAGGAA
TTAATTAATAAGACTTAG
>BDU_382 rpoC, DNA-directed RNA polymerase beta' chain
ATGAAAGAGATAAAAGATTTTGAAAAGATAAGAATAAAAATAGCATCTCC
TGACCAAATTAGAAGTTGGTCTTATGGAGAAGTTAAGAAGTCTGAAACTA
TTAATTATAGAACTTTAAGACCTGAGAAAGATGGTCTTTTTTGTGAGAGA
ATTTTTGGTACAACTAAAGAATGGGAATGCTATTGTGGAAAATTTAAGTC
GATAAGATATAAAGGTATTATTTGTGATCGTTGTAATGTTGAAGTGACTC
ATTTTAAAGTGAGACGTGAGAGAATGGGACATATTGAACTATCAGCTCCT
GTTGCTCATATTTGGTATTATAAATATATTCCTTCTAGAATTGGTCTTTT
ACTTGATATTACTGCTTCTAATTTAAATTCTATTCTTTATTATGAGAAAT
ATATTGTAATTGAGCCAGGTGATACTGACCTTAAAAAAATGCAACTTTTA
AATGAAGATGAGTATTCTGAAGCAAAAGAAAGATATGGGATGTCTTTTAG
CGCTTCAATGGGTGCTGAGGCAATTAAAACTCTACTTGAAAATCTTGATC
TTGATGAGCTTTCATCTAAGCTTAGGCTTCAAATGATTGATAAAGACGAC
AAAACAGATAAAAAACTTTTAAGACGTCTTGAAATTATTGAAAATTTTAA
GATTTCTGGTAATAAACCAGAATGGATGATTATGGATGTTCTTCCTGTTA
TTCCGCCAGAAATTAGACCTATGGTGCAACTTGATGGTGGTAGATTTGCA
ACTTCTGATCTAAATGATCTCTACAGAAGGGTAATAAATAGAAATAATCG
ATTGAGAAAACTTTTACTTCTTAATGCTCCTGAGATTATTGTTAGAAATG
AAAAAAGAATGCTTCAAGAATCAGTTGACTCTCTTTTTGATAATTCTCAT
AAGAGAAAAGTTGTTAAGGGCACATCTAATAGACCTCTTAAATCTTTATC
TGATGCGTTAAAAGGTAAACAAGGTAGATTTAGACAAAACCTTCTTGGAA
AGAGAGTTGATTATTCTGGTCGTTCTGTTATTGTTGTTGGGCCTGAACTT
AAGCTTCATCAGTGTGGTATTCCTGCAAAGATGGCTCTTGAGCTTTTTAA
ACCATTTGTGATTAGAAAATTAATTGAGAGTGAAGCCGTATTTAATATAA
AAAGGGCTAAAAGTTTAATTGAACAAGAAGTAGATGAAGTATGGCAAATT
TTGGATAATGTTATTAAAGAGCATCCTGTGCTTTTAAATAGGGCTCCAAC
CCTTCACAGATTGGGAATACAAGCTTTCGAGCCAGTTTTGGTTGAAGGCA
AGGCTATTAAATTGCATCCCCTTGTTTGTCATGCATATAATGCCGATTTT
GATGGTGATCAAATGGCCGTTCATGTTCCTTTAACTCCTGCGGCACAGGC
TGAGAGTTGGGCTTTGATGTTGTCAACTAATAATTTGTTAAATCCTGCAA
ATGGACATCCTATAGTATTTCCATCTCAAGATATTGTTTTAGGTCTTTAT
TACTTAACTATGGAGAGAAAAAATGTTATGGGAGAAGGACGTAAGTTTTC
TAACTTTAATCATGTTCTTCTTGCAATTAATAATAAAAGCTTAGATTATA
ATGCACGAATTTATGTAAAAGTTGGTGAGGAATATATAAAGACTACGGCA
GGACGTGTTGTATTTAGTGAAGCTTTGCCAGGAAAAATTTCATTTGTAAA
TAAAACTCTTAGTGATTATGAATTGCAAACTTTAATTTCTGAGGTTTATG
TTATTTATGGGTCTTCTATTGTAATTGAAATGTTAGATATTATTAAAGAG
CTTGGATTTAAATATGCTACTAAATTTGGATGTACAATAAGTATGAGTGA
TATTATTGTTCCTCAAGAGAAAAAAGTGTATGTAGAGAAGGCTAATAGGG
AGATTGCGAAAATTCAGAATGATTATACCAAAGGTGTTATTACTGGAGAA
GAGAGATATAATAACGTTGTTTCTGTTTGGTCAAAAACAAATGAAGAGCT
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TGATTTATATGATGGCTGATTCTGGTGCTCGTGGAAGTAGAAATCAGATA
CGGCAGCTTGCTGGAATGCGAGGATTAATGGCTAAAACATCGGGTGATAT
TATTGAACTTCCAATTATCTCTAACTTTAAAGAAGGACTGTCTGTTATTG
AATTCTTTATATCTACAAATGGTGCAAGAAAGGGACTTGCAGATACTGCT
CTTAAGACAGCAGATGCTGGATATTTAACGCGAAGATTGGTAGATATTGC
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AAGTTGAAGCTTTAAAAAATGGTGAGGAAATAATTGAACCTTTACGAGAA
AAAGCTGTTGGAAGTTATTCAATTGAACGGATAAAAAGTCCTATTACTGG
AGAGATTATTTTAGATGTAAATGAAGAAATTACAGAAGACAAGATAAAAG
AGTTAGAAACAGTTGGTATTGATAAACTTGTTATTAGATCTGTTTTAACT
TGTGAAGCTGAGCATGGAGTTTGTCAAAAGTGTTATGGGCGGGATTTCTC
AAACAATAAACCTGTTAGCATTGGAGAAGCTGTTGGAATAATAGCAGCAC
AGTCAATAGGTCAGCCAGGAACACAGCTTACGATGAGAACTTTCCATATT
GGAGGAGTTGCACAAGCTGGTAGTGAAGATGATAAGATTGCTCTTAAGAA
TGCTTTTATTCTAAATGGACTTGAAGGTTTTAATGTTCAAGTTGACGGAG
GATTGCTTTTTACAAGGAAGGGAGTCTTAAGGGTAATAAATGTGATTTAT
GAGGAGAGTATTAAAAAAATTAAGAAACTTAAGGTTTCAGATTCTCAAAA
AGTAATTAAGGGAATGTCTTTATTTATTGATAAAAGTGGAGTTGAGGTAT
TATCATCTCATATTGGTTACATTAAGATTAAAGATAATAAGTTGATGATT
GTTTCTGAAGAACAAGAGATTTCACTAAAGGTTGGTACAAGACTTGAAAT
AAATGTTGGAGATTATGTTGAGGCTGGACGTGTAATTGGAACATTTGATC
CGTTTGCAGAACCAATTATTGCTGAGGTTAAAGGAAAAATTAAATTTAAA
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GAATTTTGATTATTAATGATAGAGGTGTTGAAATTGCATCTTATGTATTG
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AGATATCATTGCAAAGCTTTCTAAAGGATCTGAAAAAACACAAGATATTA
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AACTTAACTGAAATGGCTAAAGTAAGTGGAGTTGTTCAATTTAAGGCAAT
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GTTGTTAGGGCTGGAGATATGCTTTGTGATGGAAGGATTAATCCTCATGA
TGTTCTTGAAATTCTTGGTGGAATTAGTTTGCAAGAATTTTTATTAGCAG
AAATTCAAGATGTTTATCGAAAGCAAGGTGTAAGTATTAATGATAAACAT
ATTGGTGTTATTATTAAGCAGATGATGAAAAAAGTTAAAATTGTTTCTGT
GGGTGATACTAATTTTGTTTATAATCAAAAGGTCGATAAGCATGCTTTTT
ATGAACAAAATAAAAGGGTTATTGAGCAAGGTGGTGAACCTGCAGTAGCT
AGTCCAATTCTTATTGGTATAACTAAAGCATCTCTTAATATTGATTCATT
TATTTCAGCTGCTTCTTTCCAAGAAACAACTAAAGTCTTAACAGATGCGT
CAATTGCTGGTAGTATTGATGATCTGAGAGGTCTTAAGGAAAATGTTGTT
ATTGGTCATTTAATTCCTACAGGAACGGGAATGAATTTATATAAAAGGGT
CAAGGTGAGAGAAAATTCAAATTCAGAAGTCTAG
>BDU_715 rpoD, RNA polymerase sigma-70 factor
ATGAATAGTGTAGATAATAAAGACTTGCAGGCTTTTAAGAAAAAAAATTC
AAAATTAATAAAGACTATTTTAAATTATTTGGGAGATAAAAAGGAAATTA
CTTTTGAGGACCTATCAACTTTTTTATCAGGAGATATGTTAGAGCCTGAT
AATATTGATTGTATTTATGGAATTCTTGAAAATGAGGGGATAGGTTTGAT
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CAAGTAAGCTTGATAGTCAATGTATGATGTTAGATGATGCTATTCAGGTT
GATGATGAGCTTGATGATAAATTGGATGATTTTGATGATGAAGTTTTAGA
CAAAGAAGATTATAATTCAGGATACATTAAAAGTGGTTTATTAAAAGATA
GTAATTCTGAGGATCCAATAAGACTTTATTTAAAAGAAATAGGAAAAGAG
TTTTTATTAACTGGAAATCAAGAAGTAGAACTTGCAAAACAAATGGATTC
TGGGGAGAGTATAATTGAAAATATTCTTAAGAACGAGGGATTAGTTATAG
AGAATTATTATAATTTGGTTAATGCTATTTATTCAAGAGTTGACAAAGAG
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CATTCCAGGATCGTTTAGTCAAGTATGTTGAGAGAAAGCATAGATTATAT
GAACTTGGTGAGGATATTTTTGAAGAGAGTATTACTAATGAGAGATTACA
GATAAAAGAGCTTCTTAAGTCGATTCCTTTATATCAGGAGGAATTACGTC
TGTTTTCAGATGATTATATTGATTCTGCTAGCAAGATAAAAGATTTAAAG
AGGCAACAAAAATCTATACTGGATAGATTGAAAATAGATAAGGTGCGAAA
TCTTAGAATTCTTGGCAGGGATTTGGCTATTCCTGAGAAGAGAGAGAGAA
TAGAAAAATCTTTAAATATTAGGGAAGATTTAATTAAGGAACAAATTACA
GAAGCTCAACTTGCTCAAAAAGAACTTGAGCGGATTGAGATGTATTATGA
ATATCCAATGGATAAGATAATAAGTATGTCAGAAGAGATCCTTAAGGGTA
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CTTGTTGTAAGTATTGCTAAAAAATATGCTAATAGAGGTTTACATTTCTT
TGATCTTGTTCAAGAGGGTAATATTGGTCTAATTAAAGCGGTTGAAAAAT
TTGAGTATAAAAGGGGATTTAAGTTTTCTACTTATGCTACATGGTGGATT
CGTCAGGCAATAACAAGATCAATATCAGATCAGGCACGTACCATTCGTGT
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ATTTAGTTCAGGTTTTAGGTAAAGATCCAACAGATGAAGAGTTATCAATT
AGGCTTGGTTGGGATCTCAAAAAAGTAAAAACCGTAAAGAATGTTTCAAG
AGAACCTGTTTCACTTGAAACACCAATTGGAGAAGAAGAGGATTCTGTGC
TTAGTGATTTTATTGAAGATAAGGCGATTAAAAATCCAGCAAAGCATACA
TCTTTTGTTGTATTACAGGATCAAATAAGGGCAGTTCTTGGAACTTTGCC
AGAGAGAGAACAAGAAGTTGTTAAGATGAGATTTGGTCTTGAGGATGGAT
ATTCTTTAACTCTTGAAGAAGTGGGATTACATTTTAATGTTACAAGAGAG
AGAATTAGACAAATTGAGTCTAAAGCCTTGAGGAGACTTAAGAATCCAAA
AAAAACCCAGAAACTTAAAGATTATTTGGAAGATTTAAATTGA
>BDU_775 rpoS, RNA polymerase sigma factor
GTGAATATATTTAGCAATGAAGATTTAAATATATATCTAAAATCTGTAAG
AGAACATAGACTTATAACTCACGAAGAAGAAATCGAACTTGCAAAACAGA
TAAAACTAGGAAGCTTAAAAGCAAAAAACCAAATGATAAATGCCAACTTA
CGTTTAGTTCTCAAAATAATTAAAAGATATGCTGGTAAAGGATTAAAAAT
AGAAGATCTAATACAAGAAGGAAATTTAGGTTTAATTAGAGCTGCAGAAA
AATATGATCCGAGTAAAAATACCAAATTTTCAACTTATGCTTCATTTTGG
ATTAAACAATCTCTTCAAAGGGCATTAAACACAAAAACAAGACTTGTAAA
AGTACCATACAGAAAAGAAAATTTAATACTTCAAATCAATAAATATCTAA
TGGAAGAAGAAAAATCACCCAAAAAAGAAGACATAATGGAAAGATTTAAC
TTGACAACTGCTCAATATGTAAAGATTATTCCTTACCTTGAAAAAGAATA
TTCTCTAGATAAAAAGATTGAAGGATCAGAAAATTCCACGCTACTAAATC
TCTATGAAGATAATTCTTTTAATCCTGAGAGTACTCTTGAACAAAATTCA
ACATTAAAGCATCTAAACTATATACTAGAAACTAAACTAAATGAAAAAGA
AAGATATATAATCAAGAAAAGATACAATTTGGACAATAGTGATAAAAAAA
GCACATTAAAAGATATTTCTACAGAACTTGGAATATCTTCAGAAACTGTA
AGACAGATCGAAAAAAGAGTACTAAAAAAACTCAGAGAAGAACTTTATCA
ATAA
>BDU_431 spo0J, stage 0 sporulation protein J
ATGGATGAATCTTTAAAAATGGTAGATATAAATCTTTTAGATATAGATAA
ATCACAGCCTAGAAAGTCTATCAATCTTGCTGAACTTGAAGAATTAAGTA
TTTCTATAAAAGAAAATGGAATATTACAGCCTATTATTGTTTATCCTAAT
AATGGTAGGTATAACATAATAATAGGGGAGAGGAGATTTAGAGCTGCTAA
ACTTTCAGGTATGAGTCAGATTCCTGTTATAGAGATAGAGGCTAGTACAA
AAGATAAAGATTTTATGTCATTAATTGAAAATATTCAACGTGAAAACTTA
ACTCCTGTTGAAGAAGCGTATGCTTATAAAAATCTTATGGACAAACATGC
TTTAACCCAAAAAGCTTTATCTGAAAAAATAGGTAAAAATAGATCTCATG
TTGCCAATTTAGTTAGGATTTTAGAACTTGAACAAGAAATATTAAATTCT
TTGCATAAAAAAGAAATATCATTGGGTCATGCTAAAGTTTTATTGTCGTT
AAAGGATAATCAAGATAGATATGCCCTTTATCTTTTAATAATTAAAAAGA
AATTGTCTGTGAGAGATGCGGAAAATTATGTTAAAAATCTTTATAAAACT
ATCAATGATAAATCAGAAATTTCTAGAGATCCTTTTTTAAATAGTATTAA
AGAATTTTTAATAAGCAGAATACAAACTAAAATAAGTATTAAAGGAAGTA
AGGAAAAGGGAAAAATAGAAATAAGTTATTTTACATCTTCTGATTTAAAG
AGAATCATCTCTATTTTTGAAAATATTAAGTAA
>BDU_196 spoT, guanosine-3,5-bis(diphosphate) 3-pyrophosphohydrolase
ATGATACAAGTCTATGAAATTGCATACTTACTTAAAATAAATGATATTGA
TAAATTAAAAAATATTTTCAAAAAAACTGTAGATAATACTTATCAAGATG
ACATTCAAAAAAAATTAATATTTAAATCTCTTGAAATATCAGAGCAATTA
CACTACGGACAATATAGAGAGAGCAAAGAACCATATGTAATTCACCCAAT
AATGGTTGCACTATTTCTTATAAAATTTCAGTTGGATTTTAAAACAATAA
TAGCTGGTTTATTACATGATGTTTTAGAAGACACAAGTGTTCAAAAAGAA
GAAATCATTAAAGAATTTGATCAAGAAGTTTTCAGTTTAATTGATGGGGT
AACCAAAATTCATGATTTGCACAATAAAACAAGAGCAATCAAAGAAGCAA
ATACAATCTCAAAAATGTTTTTTGCAATGACTCATGACATTAGAATAATA
ATAATAAAACTTGCAGATAAATTACATAACATGGCAACGCTTTCTCACTT
ACCTAAAAATCGAAGAGAAAGAATTGCAAGAGATTGTCTTGCAACTTACG
TACCAATTGCAGAAAGACTTGGTATCTCATCTCTTAAAATATATCTTGAA
GATTTATCATTAAAATATCTTTATCCAAAAGAATATAAAGAAATAAAAAA
TTTTTTATCCGCAACAAAAATAGAAAGAGAAAAAAAATTATATAAAGGAA
AATTAATAATAGAAAAAGAACTCAAAAAAATTGGAATTGACGTCACAATC
ACAGTGCGTTCAAAACATTTTTACTCAATATTTAGAAAAATGAAAACAAG
AAATAACAATATTTCTCAAATTTTTGATACTTTGGGAATAAGAATAATTT
GCAAGAAACAAAAAGAATGTTACGAAATACTAGAAATCGTACATAAAGTT
TGGAAACCAATACCTGGAAGACTTAAAGACTATATAGCCATTCCTAAAGA
AAATAAATATCAATCTCTACATACAACTGTCAGAATACCTGAAGATAATC
AATTAATCGAAATACAAATTAGAACAGAAGAAATGGATAAAATTGCAAAA
TATGGTGTTGCTGCCCACTGGCTTTATAAAGAACAAGTTGAATTAAAAGC
TGATGATATATCATTTATCAATCGAATTAAAAAATGGCAACAAGAATCGG
CCAATAAAAATCAATACTCAATGCACGATATACATAAGGAACTTCTAAAT
ACATTTATATATGTCTATACACCAGAAGGAGAAATAGTCGAACTTCCATT
TGGTTCAAACTCAATTGACTTTGCATATACAATACATACAGATATTGGGG
ATCAAGCACTTTATGCAAAAATCAATGGCAAAATTAGTTCATTAACCAAA
CCATTAAAAAACGAACAAATTGTTGAAATATTCACATCTGAAGAAGCAAA
ACCTGATGTAATTTGGTTAAATAGCGTTAGAACAAAAAAAGCACGTTCAA
AAATTAGATCTTGGCTTAACAAAAATGACAATACAATATTTGTAGACAAT
AACATAATTGCATATTTGATTGGAGAAAATAAAGAACAAAAAAGACTATT
TAGTCTATTTAAATCTCTAACAAAATCTAAACTCAAAAGCATTACAACAG
CTTCTGATTGTAACCCATTAACAGGTGAAGATATTATTGGTTTAATACAA
AAAGATACAATCGTGGTTCATAAAGAAAATTGTAAAGAAATCACATATCA
GAAAAAAAACCATCTGGTAGAAGTAGAATGGGAAGCAACACCAACAAGGA
AAGTGTATCATATTATAATATTTTTAAAAAATTTAAAAGATCTCTTTAAT
TACCTAGATAATCTCTTTACAACATTTGATGTAAGACTTATTAGTGAAAA
AATAGAAGACTGTGGAAATGGACACGGAATAATAAATATTATAATATTAT
CAAACCATAAAAATGTATCAATGATTTTTAATTCACTTAAAGAAAATCCT
AATGTACTTCAAATAATGCAAGTGGAAGAAGACATAAAAAACTATGACAA
TTAA
>BDU_9001 vlp-d, vlp protein, delta subfamily
GTGAAGAGAGAGGATAAGATGTGGGATAGAATGAGAATGAAGGGAATAAT
ATTGATGATGATGATAGTGATGATGATGGGATGTAATAGTGGAGGAGTGA
AGGATGCAGAGAAAGTATTTTTGAGTGAGATGGTAAATTTAGGGAAAGGA
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