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COG category: NOT ANALYZED
Organism: Borrelia afzelii, PKo

Number of genes found: 38

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# Borrelia afzelii, PKo

>BAPKO_0440 28S ribosomal RNA
TATGGCCAAAGATACGGGTAATTAGTATTAGTCAGCTTAATATATTACTA
TACTTACACTTCTAACCTATCAACCTGGTATTCTTCCAGGACCCTTAAAG
GATATCTCATCTTGAGGAAGGCTTCCCACTTAGATGCTTTCAGCGGTTAT
CCTTTCCGAACGTAGCTACCCAGCACTTACCCTTGGCAGGATAACTGGTA
CACTAGAGGTTCGTCCATCTCGGTCCTCTCGTACTAAAGATAGCTCCTCT
CAAATATCCAACGCTTGTGGCAGATAGGGACCAAACTGTCTCACGACGTT
CTGAACCCAGCTCGCGTACCGCTTTAAATGGCGAACAGCCATACCCTTAG
GACCTGCTCCAGCCCTAGGATGCGATGAGCCGACATCGAGGTGCCAAACC
CTTCCGTCGATGTGAACTCTTGGGAAGGATAAGCCTGTTATCCCCGGAGT
ACCTTTTATTCGTTAAGTGACGGCGCTTCCACTTGCCACCGCCAGATCAC
TAAGACCTACTTTCGTATCTGTTCGACTTGTCAGTCTTACAGTTAAGCTA
CCTTATGCCTTTACACTTACAGAGTGATTTCCAACCACTCTAAGGTAACC
TTTGCGCACCTCCGTTACTCTTTAGGAGGCGACCGCCCCAGTCAAACTAC
CCACCTGGCACTCTCCTCATATTTCTATAAGTTAGAAACTTAATTAAACA
AGGGTGGTATTTCAAGATTGACTCCACCATCCCTAACGAGATAGCTTCAA
AGTCTCCCACCTATCCTACACATATTTAATCAAATCTCAATACCAAGCTA
TAGTAAAGGTTCACGGGGTCTTTCCGTCTAACCACAAGTAATCGGCATCT
TCACCGATACTTCAATTTCACCGAGCTCCACGTTGAGACAGCGTCCAAAT
CGTTACACCATTCGTGCGGGTCGGAACTTACCCGACAAGGAATTTCGCTA
CCTTAGGACCGTTATAGTTACGGCCGCCGTTTACTGGGGCTTAAATTCAA
TGCTTCGAATAAACTAACATCTCCTCTTAACCTTCCAGCACCGGGCAGGT
GTCAGTCCCTATACTTCTCTTTACAGATTTGCAGAGACCTGTGTTTTTGG
TAAACAGTCGTTTGGACCATTTTTATGCTACCTAATTGCTTAGGTCGTAC
TTATCCCGAAGTTACGTACGTATTTTGCAGAGTTCCTTAACGTGGATTCT
CTCGCGCGCCTTAGAATTTTCATCCCACCTACCTGTGTCGGTTTGCGGTA
CGGTCCCTTATAGCCTAACCTTAGAAGCTATTTCTTGGCACCTTGACTAC
CTACATTTCATGTTACCTAAATAACACTCATCATCACATCTTAGCTCTCT
TAACGGATTTTCCTATTAAGATCATCGCCTTAATGCTTAAACTAGGACAA
CCATCGCCTAGCAGTAGTTAACCTCATGCGTCACTCCATCGAAACTATAA
GAGGTACGGGAATATTAACCCGTTTCCCATCGACTACACTTTTCAGCTTT
GCCTTAGGGGCCGACTAACCCTGGGAAGACGACCTTTACCCAGGAAACCT
TAGGTTTTCGGCGAATGGGAATCTCACCCATTTTTTCGTTACTCATACCT
GCATTCTCACTTCTGATACCTCCATCAAACTTTCCAGTTTAACTTCTCTG
GCTTACAGAACGCTCCCCTACCATCTTAACTTTCGTTAAGATCCAAAGCT
TCGGTAATGTGTTTAGCCCCGTTACATTATCGGCGCTTAAGTACTCGACC
AGTGAGCTATTACGCACTCTTTAAAGGTATGGCTGCTTCTAAGCCAACCT
CCTGGCTGTTTACGTACCTAAACCTCCTTTTCCACTTAACACATTTTTGA
GACCTTAGCTGTTGGTCTGGGTTGTTTCCCTCTCGACTATGAACCTTATC
GCCCATAGTCTCACTCCCATTCATCATTTAATAGCATTCGGAGTTTAACT
GAGTTTGGTACCCTTTGACAGGCCCTAGCTTAATTAGTGCTCTACCTCTA
TTAAACTAAAATAAGGCTGAACTTAAATCCATTTCGGGGAGAACCAGCTA
TCTCCGAGTTTGTTTAGCCTTTCACTCCTATTCACAGCTCATCCCTGCCT
TTTTAAACAGACTAGAGTTCGGCCCTCCACTTGGTTTTACCCAAGCTTCA
GCCTGGCCATAAATAGATCACTCGGCTTCGGGTCTACCACATCTAACTAA
ATCGCCCTTTTAAGACTCGCTTTCGCTTCGACTCCAGCACTTCTATGCTT
TAATCTTGCTAGATATGATAACTCGCAGGTTCATTATGCAAAAGGCACGC
CATCACCGCAATAAATCGCGGCTTTGACTGCTTGTAAGTCTACGGTTTCA
GTTCTATTTCACTCCCCTCCCGGGGTTCTTTTCACCTTTCCCTCACGGTA
CTCTTCTCTATCGGTAGCTTTTTAGTATTTAGCCTTGGAGAGTGGTCTCC
CCAGCTTCAAACAAGGTTTCTCGTGCCTCGTCCTACTCAGGAACATTTTA
AAAAGATATTTACATTTAAATTACAGGACTATCACCTTCTTTGGTTAAAC
TTTCCAGATTATTCTTCTATATAAATATTTTGTAACTTTTTTGCTTATCA
CAGACTAAGCCTAAACGTCCTACAACCCTCTAAATGCAACGCTCTGCAAC
TTGACACATTTAAAGTTTGGGCTACTCCCCTTTCGCTCGCCACTACTAAG
GGAATCTCTTTGATTTCTTTTCCTCAGGGTACTTAGATGGTTCACTTCCC
CTGGTATCGCCTCTATTATTTAAATAATAGATAGCTAGCATCTTGCTAGC
TGGATTACTCCATTCGGTAATCTTGGGATCAATAAATGTTTGCTTCTCCC
CCAAGCTTTTCGCAGCTTACCACGACCTTCTTCGCCTTAAAGCTCCTAGG
CATCCACCATAGACTCTTATTACTTTGACCATAT
>BAPKO_0439 5S ribosomal RNA
CCCTGGCAATAACTTACTCTCCCGCGAACTCGCAGTACCATCAGCGAATA
AGAGCTTAACTTCTGTGTTCGGAATGATAACAGGTGTTTCCTCTTTTCTT
TAACCACCAGGG
>BAPKO_0437 5S ribosomal RNA
CCCTGGCAATAACTTACTCTCCCGCGAACTCGCAGTACCATTAGCGAATA
AGAGCTTAACTTCTGTGTTCGGAATGATAACAGGTGTTTCCTCTTTTCTT
TAACCACCAGGG
>BAPKO_0438 28S ribosomal RNA
TATGGCCAAAGATATGGGTAATTAGTATTAGTCAGCTTAATATATTACTA
TACTTACACTTCTAACCTATCAACCTGGTATTCTTCCAGGACCCTTAAAG
GATATCTCATCTTGAGGAAGGCTTCCCACTTAGATGCTTTCAGCGGTTAT
CCTTTCCGAACGTAGCTACCCAGCACTTACCCTTGGCAGGATAACTGGTA
CACTAGAGGTTCGTCCATCTCGGTCCTCTCGTACTAAAGATAGCTCCTCT
CAAATATCCAACGCTTGTGGCAGATAGGGACCAAACTGTCTCACGACGTT
CTGAACCCAGCTCGCGTACCGCTTTAAATGGCGAACAGCCATACCCTTAG
GACCTGCTCCAGCCCTAGGATGCGATGAGCCGACATCGAGGTGCCAAACC
CTTCCGTCGATGTGAACTCTTGGGAAGGATAAGCCTGTTATCCCCGGAGT
ACCTTTTATTCGTTAAGTGACGGCGCTTCCACTTGCCACCGCCAGATCAC
TAAGACCTACTTTCGTATCTGTTCGACTTGTCAGTCTTACAGTTAAGCTA
CCTTATGCCTTTACACTTACAGAGTGATTTCCAACCACTCTAAGGTAACC
TTTGCGCACCTCCGTTACTCTTTAGGAGGCGACCGCCCCAGTCAAACTAC
CCACCTGGCACTCTCCTCATATTTCTATAAGTTAGAAACTTAATTAAACA
AGGGTGGTATTTCAAGATTGACTCCACCATCCCTAACGAGATAGCTTCAA
AGTCTCCCACCTATCCTACACATATTTAATCAAATCTCAATACCAAGCTA
TAGTAAAGGTTCACGGGGTCTTTCCGTCTAACCACAAGTAATCGGCATCT
TCACCGATACTTCAATTTCACCGAGCTCCACGTTGAGACAGCGTCCAAAT
CGTTACACCATTCGTGCGGGTCGGAACTTACCCGACAAGGAATTTCGCTA
CCTTAGGACCGTTATAGTTACGGCCGCCGTTTACTGGGGCTTAAATTCAA
TGCTTCGAATAAACTAACATCTCCTCTTAACCTTCCAGCACCGGGCAGGT
GTCAGTCCCTATACTTCTCTTTACAGATTTGCAGAGACCTGTGTTTTTGG
TAAACAGTCGTTTGGACCATTTTTATGCTACCTAATTGCTTAGGTCGTAC
TTATCCCGAAGTTACGTACGTATTTTGCAGAGTTCCTTAACGTGGATTCT
CTCGCGCGCCTTAGAATTTTCATCCCACCTACCTGTGTCGGTTTGCGGTA
CGGTCCCTTATAGCCTAACCTTAGAAGCTATTTCTTGGCACCTTGACTAC
CTACATTTCATGTTACCTAAATAACACTCATCATCACATCTTAGCTCTCT
TAACGGATTTTCCTATTAAGATCATCGCCTTAATGCTTAAACTAGGACAA
CCATCGCCTAGCAGTAGTTAACCTCATGCGTCACTCCATCGAAACTATAA
GAGGTACGGGAATATTAACCCGTTTCCCATCGACTACACTTTTCAGCTTT
GCCTTAGGGGCCGACTAACCCTGGGAAGACGACCTTTACCCAGGAAACCT
TAGGTTTTCGGCGAATGGGAATCTCACCCATTTTTTCGTTACTCATACCT
GCATTCTCACTTCTGATACCTCCATCAAACTTTCCAGTTTAACTTCTCTG
GCTTACAGAACGCTCCCCTACCATCTTAACTTTCGTTAAGATCCAAAGCT
TCGGTAATGTGTTTAGCCCCGTTACATTATCGGCGCTTAAGTACTCGACC
AGTGAGCTATTACGCACTCTTTAAAGGTATGGCTGCTTCTAAGCCAACCT
CCTGGCTGTTTACGTACCTAAACCTCCTTTTCCACTTAACACATTTTTGA
GACCTTAGCTGTTGGTCTGGGTTGTTTCCCTCTCGACTATGAACCTTATC
GCCCATAGTCTCACTCCCATTCATCATTTAATAGCATTCGGAGTTTAACT
GAGTTTGGTACCCTTTGACAGGCCCTAGCTTAATTAGTGCTCTACCTCTA
TTAAACTAAAATAAGGCTGAACTTAAATCCATTTCGGGGAGAACCAGCTA
TCTCCGAGTTTGTTTAGCCTTTCACTCCTATTCACAGCTCATCCCTGCCT
TTTTAAACAGACTAGAGTTCGGCCCTCCACTTGGTTTTACCCAAGCTTCA
GCCTGGCCATAAATAGATCACTCGGCTTCGGGTCTACCACATCTAACTAA
ATCGCCCTTTTAAGACTCGCTTTCGCTTCGACTCCAGCACTTCTATGCTT
TAATCTTGCTAGATATGATAACTCGCAGGTTCATTATGCAAAAGGCACGC
CATCACCGCAATAAATCGCGGCTTTGACTGCTTGTAAGTCTACGGTTTCA
GTTCTATTTCACTCCCCTCCCGGGGTTCTTTTCACCTTTCCCTCACGGTA
CTCTTCTCTATCGGTAGCTTTTTAGTATTTAGCCTTGGAGAGTGGTCTCC
CCAGCTTCAAACAAGGTTTCTCGTGCCTCGTCCTACTCAGGAACATTTTA
AAAAGATATTTACATTTAAATTACAGGACTATCACCTTCTTTGGTTAAAC
TTTCCAGATTATTCTTCTATATAAATATTTTGTAACTTTTTTGCTTATCA
CAGACTAAGCCTAAACGTCCTACAACCCTCTAAATGCAACGCTCTGCAAC
TTGACACATTTAAAGTTTGGGCTACTCCCCTTTCGCTCGCCACTACTAAG
GGAATCTCTTTGATTTCTTTTCCTCAGGGTACTTAGATGGTTCACTTCCC
CTGGTATCGCCTCTATTATTTAGATAATAGATAGCTAGCATCTTGCTAGC
TGGATTACTCCATTCGGTAATCTTGGGATCAATAAATGTTTGCTTATCCC
CCAAGCTTTTCGCAGCTTACCACGACCTTCTTCGCCTTAAAGCTCCTAGG
CATCCACCATAGACTCTTATTACTTTGACCATAT
>BAPKO_0447 16S ribosomal RNA
AATAACGAAGAGTTTGATCCTGGCTTAGAACTAACGCTGGCAGTGCGTCT
TAAGCATGCAAGTCAAACGGAATGTAGCAATACATTTAGTGGCGAACGGG
TGAGTAACGCGTGGATGATCTACCTATGAGATGGGGATAACTACTAGAAA
TAGTAGCTAATACCGAATAAGGTCAATTAATTTGTTAATTGATGAAAGGA
AGCCTTTAAAGCTTCGCTTGTAGATGAGTCTGCGTCTTATTAGTTAGTTG
GTGGGGTAAATGCCTACCAAGACGATGATAAGTAACCGGCCTGAGAGGGT
GAACGGTCACACTGGAACTGAGATACGGTCCAGACTCCTACGGGAGGCAG
CAGCTAAGAATCTTCCGCAATGGGCGAAAGCCTGACGGAGCGACACTGCG
TGAATGAAGAAGGTCGAAAGATTGTAAAATTCTTTTATAAATGAGGAATA
AGCTTTGTAGGAAATGACAAAGCGATGACGTTAATTTATGAATAAGCCCC
GGCTAATTACGTGCCAGCAGCCGCGGTAATACGTAAGGGGCGAGCGTTGT
TCGGGATTATTGGGCGTAAAGGGTGAGTAGGCGGATATATAAGTCTATGC
ATAAAATACCACAGCTCAACTGTGGAGCTATGTTGGAAACTATATGTCTA
GAGTCTGATAGAGGAAGTTAGAATTCCTGGTGTAAGGGTGGAATCTGTTG
ATATCAGGAAGAATACCGGAGGCGAAGGCGAACTTCTGGGTCAAGACTGA
CGCTGAGTCACGAAAGCGTAGGTAGCAAACAGGATTAGATACCCTGGTAG
TCTACGCTGTAAACGATGCACACTTGGTGTTAACTAAAAGTTAGTACCGA
AGCTAACGTGTTAAGTGTGCCGCCTGGGGAGTATGCTCGCAAGAGTGAAA
CTCAAAGGAATTGACGGGGGCCCGCACAAGCGGTGGAGCATGTGGTTTAA
TTCGATGATACGCGAGGAACCTTACCAGGGCTTGACATATATAGGATATA
GTTAGAGATAATTATTCCCCGTTTGGGGTCTATATACAGGTGCTGCATGG
TTGTCGTCAGCTCGTGCTGTGAGGTGTTGGGTTAAGTCCCGCAACGAGCG
CAACCCTTGTTATCTGTTACCAGCATGTAATGATGGGGACTCAGATAAGA
CTGCCGGTGATAAGTCGGAGGAAGGTGAGGATGACGTCAAATCATCATGG
CCCTTATGTCCTGGGCTACACACGTGCTACAATGGCCTGTACAAAGCGAA
GCGAAACAGTGATGTGAAGCAAAACGCACAAAGCAGGTCTCAGTCCGGAT
TGAAGTCTGAAACTCGACTTCATGAAGTTGGAATCGCTAGTAATCGTATA
TCAGAATGATACGGTGAATACGTTCTCGGGCCTTGTACACACCGCCCGTC
ACACCACCCGAGTTGAGGATACCCGAAGCTATTATTCTAACCCGTAAGGG
AGGAAGGTATTTAAGGTATGTTTAGTGAGGGGGGTGAAGTCGTAACAAGG
TAGCCGTACTGGAAAGTGCGGCTGGATCACCTCCTTT
>BAPKO_0562 tRNA-Pseudo, 
GTCCTCTTCGTCTATCGGTCAGGACTCCAGGTTTTCATCCTGGCAAGAGG
GGTTCGATTCCCCTAGAGGATG
>BAPKO_0446 trnA, tRNA-Ala
GGGGGTTTAGCTCAGTTGGCTAGAGCATCGGCTTTGCAAGCCGAGGGTCA
AGGGTTCGAGTCCCTTAACCTCCA
>BAPKO_0205 trnC, tRNA-Cys
GGCGCTGTACCCAAGTGGCTAAGGGAGAAGTCTGCAAAACTTTGATTCGC
CGGTTCGATTCCGGTCAGCGCCT
>BAPKO_0674 trnD, tRNA-Asp
GGGGGCGTAGTTCAGATGGTTAGAACGCCTGCCTGTCACGCAGGAGGTCG
CGGGTTCGAGACCCGTCGCTCCCG
>BAPKO_0210 trnF-1, tRNA-Phe
GCTGCTGTAGCTCAGTTGGTAGAGCATAGGACTGAAAATCCTTGTGTCAG
GAGTTCGATTCTCCTCGGCAGCA
>BAPKO_0211 trnF-2, tRNA-Phe
GTCGCTGTAGCTCAGTTGGTAGAGCATAGGACTGAAAATCCTTGTGTCAG
GAGTTCGATTCTCCTCGGCGACA
>BAPKO_0048 trnG-1, tRNA-Gly
GCGTCCTTCGTATAATGGCTATTACCTTAGCCTTCCAAGCTAATGATGTC
GGTTCGATTCCGATAGGACGCT
>BAPKO_0645 trnG-2, tRNA-Gly
GCGAAAGTAACTCAGGGGTAGAGTGTCACCTTGCCAAGGTGGAAGTCGCG
GGTTCAAATCCCGTCTTTCGCT
>BAPKO_0642 trnH, tRNA-His
GTGGTTGTAGCTCAGTTGGTAGAGCGTCGGGTTGTGGTTCCGAATGTCGC
GGGTTCAAGCCCCGTCAATCACC
>BAPKO_0444 trnI, tRNA-Ile
GGGATCATAGCTCAGGTGGTTAGAGCGCAGGTCTGATAAACCTGAGGTCG
GATGTTCAACTCATCCTGGTCCCA
>BAPKO_0563 trnK-1, tRNA-Lys
GGGCTCATAGCTCAGGTGGTAGAGCAGCGCCCTTTTAAGGCGTTTGTCGT
AGGTTCGAGTCCTACTGAGCTCA
>BAPKO_0564 trnK-2, tRNA-Lys
GGGCTGCTAGCTCAAGTGGTAGAGCATCGGACTCTTAATCCGTTGGTTAC
AGGTTCAAGTCCTGTGCAGCTCA
>BAPKO_0260 trnL-1, tRNA-Leu
GCTGTGGTGGTGGAAGTGGTAGACACGCTAGCTTGAGGGGCTAGTGGGCG
ATAAGCCCATGCTGGTTCAAGTCCAGTTCACAGCA
>BAPKO_0601 trnL-2, tRNA-Leu
GCCGGTATGGCGGAATTGGTAGACGCGTCAGACTCAAAATCTGATGGGGG
CAACTTCGTGTCGGTTCGACTCCGACTACCGGTA
>BAPKO_0644 trnL-3, tRNA-Leu
GCAGGAGTGGTGGAATTGGCAGACACGCTAGACTTAGGATCTAGTGCTTT
TGGCGTGTGGGTTCGACTCCCACCTTCTGTA
>BAPKO_0806 trnL-4, tRNA-Leu
GCCGAAGTGGTGGAAGTGGTAGACACACAGGACTTAAAATCCTGAGGAGG
AAGCTCCGTACCGGTTCAAGTCCGGTCTTCGGTA
>BAPKO_0220 trnM-1, tRNA-Met
GGGCCCATAGCTCAGTTGGTTAGAGCACCCGACTCATAATCGGTAGGTCC
CAGGTTCAAGTCCTGGTGGGCCCA
>BAPKO_0653 trnM-2, tRNA-Met
CGCAGGGTAGAGCAGTTGGTAGCTCGTCGGGCTCATAACCCGAAGGTCAT
AGGTTCGAGTCCTATCCCTGCTA
>BAPKO_0659 trnM-3, tRNA-Met
GCTGATGTAGCTCAGTTGGTTAGAGCACTCGGCTCATATCCGAGTTGTCG
TGGGTTCAAGTCCCTCCATCAGCA
>BAPKO_0666 trnN, tRNA-Asn
TCCCCTATAGCTCAGTGGTAGAGCGGGTGGCTGTTAACCACTAGGTCGGA
GGTTCAAGTCCTTCTGGGGGAG
>BAPKO_0789 trnP, tRNA-Pro
CGGGATGTGGCCTAGTGGCTAAGGCACCTGCTTTGGGAGCAGGGGATCGT
GAGTTCGAATCCCACCATCCCGA
>BAPKO_0837 trnQ, tRNA-Gln
TGGGACGTCGACAAGCGGTAAGTCAACTGGTTTTGGTCCAGTCATTCGAG
GGTTCGAATCCTTCCGTCCCAG
>BAPKO_0487 trnR-1, tRNA-Arg
GTGTCCATAGCTCAGTTGGATAGAGCGTTAGATTGCGATTCTTAAGGTCG
GAGGTTCAAGTCCTCTTGGACACG
>BAPKO_0643 trnR-2, tRNA-Arg
GCATTCATAGCTCAATTGGATAGAGCAGTGGACTTCGAATCCGAAGGTTG
CAGGTTCGAATCCTGCTGAGTGCG
>BAPKO_0790 trnR-3, tRNA-Arg
GCACCAATAGCTCAATTGGATAGAGCAACAGACTTCTAATCTGTAGGTTT
TAGGTTCGAGTCCTAATTGGTGCG
>BAPKO_0484 trnS-1, tRNA-Ser
GGAGAGATGCCAGAGTGGCCGAATGGGGCTTCCTGCTAAGAAGTTGTCCT
TTTAAAAAGGGGACCATGGGTTCGAATCCCATTCTCTCCG
>BAPKO_0485 trnS-2, tRNA-Ser
GGAGAGGTGGCAGAGTGGTTTAATGCTACGGTCTTGAAAACCGTTGTAGG
TGTAAGCCTACCGTGAGTTCGAATCTCACCCTCTCCG
>BAPKO_0488 trnS-3, tRNA-Ser
GGAGAGATGGCCGAGTGGCTTAAGGCGCACGCTTGGAAAGCGTGTATACG
GTAAAATGTATCATGGGTTCGAATCCCATTCTCTCCG
>BAPKO_0413 trnT-1, tRNA-Thr
GCCCTTATAGCTCAGTTGGTAGAGCACCACCATGGTAAGGTGGGGGTCGT
CGGTTCAAGTCCGATTGAGGGCT
>BAPKO_0752 trnT-2, tRNA-Thr
GCCGACTTAGCTCAGCTGGCCAGAGCAGCGGTCTTGTAAACCGCAGGTCG
TCGGTTCGACTCCGACAGTCGGCT
>BAPKO_0733 trnV, tRNA-Val
GGGCTCATAGCTCAGTTGGTCAGAGCGCCTGCCTTACAAGCAGGATGTCG
GGAGTTCGAATCTCTCTGGGCCCA
>BAPKO_0411 trnW, tRNA-Trp
AGGTCAGTAGTTCCAACGGTAGAACGACAGTCTCCAAAACTGTATGCTGG
GGGTTCGAATCCCTCCTGACCTG
>BAPKO_0753 trnY, tRNA-Tyr
GGGGCGGTACCGAAGTGGTTAACCGGGGCAGACTGTAAATCTGTTGGCTT
TGCCTACGTGGGTTCGAATCCCACCCTCCCCA